隨著檢測技術及精密儀器的發展，真菌毒素檢測手段也在不斷更新。從早的借助于薄層色譜，不斷發展為依靠色譜、質譜等儀器實現更加準確、更安全快速的分析。越來越多的新方法，新技術被應用在真菌毒素檢測領域，如噬菌體免疫PCR技術可以實現更高的檢測靈敏度和多毒素同步檢測、通過電子鼻技術探索揮發性物質與真菌毒素關系有望實現無損無前處理預警，等等。  

      真菌毒素樣品前處理技術也逐漸從單一處理發展為集成、自動化處理。前處理方面目前應用較多的是免疫親和柱凈化及內標技術，目前應用較多的主要為免疫親和柱凈化-液相色譜法、同位素內標-液相色譜質譜聯用法。相較于其他凈化方式，免疫親和柱具有特異性好，結合效率高，凈化效果好等特點，并可同時實現凈化富集，不需要特殊的化學試劑，相對環保，因此被大多數國內外檢測標準采用。

      真菌毒素檢測技術發展趨勢 真菌毒素檢測技術發展至今，越來越趨向于快速、準確、高效、自動及多毒素同時檢測。前處理技術日趨便捷、環保、低成本。當真菌毒素檢測覆蓋面越發寬廣之后，在保障檢測結果準確性的同時，檢測成本的控制及大批量樣品處理的便捷度將成為檢測的關注點。因而前處理技術的變更會更為快速，新技術的涌入也將層出不窮。

      各種新技術、新手段還需要從研究走向應用，接受時間的驗證。 在分析儀器方面，雖然新的分析儀器應用在真菌毒素檢測上的研究陸續發表，但在短期內，液相色譜、液質聯用作為主流的確證分析儀器和分析手段仍將沿用較長時間。而將二者結合的技術，也是一個新的突破口。如將前處理耗材與分析儀器聯合使用，實現自動化操作、通過在線處理實現耗材的多次使用等等。